从应用角度国土资源管理部门综合财务管理系统功能可分为决策层、管理层、操作层三部分，如下图所示：

决策层

主要包括财务分析、电子报表和辅助决策支持系统（DSS），为主管部门高层领导提供决策信息。通过对主管部门财务管理业务、数据挖掘分析建立主管部门预警预测模型，为科学制定和调整各项政策提供支持。通过主管部门纵向互联网络对财务管理业务运行进行监控，提高资金使用效益，为财务监管提供全面和及时的支持。在业务信息系统对财务管理数据实现自动记录和科学管理基础上，可以逐步建设和完善各种智能化的管理决策支持系统，增强信息系统的分析预警和辅助决策功能。

管理层

主要包括会计核算子系统、项目管理子系统和财务管理子系统。利用信息技术，整合和优化业务处理模式，实现主管部门的资金从预算到核算及决算全过程、全生命周期的一体化管理，形成一个完整的信息环，保证资金数据完整性与准确性。

操作层

主要包括会计核算子系统、项目管理子系统和财务管理子系统。操作层是主管部门本级以及其下属单位。通过网络及信息技术实现财务综合业务管理的流程化控制，实时记录业务操作信息。

会计核算子系统、项目管理子系统和财务管理子系统贯穿管理层、操作层，同时为主管部门本级以及其下属单位提供服务。

系统部署架构

在传统财务管理模式下，财务数据是分散存放与管理的，这种模式使得财务与业务信息形成一个个信息孤岛，制约着财务管理水平的提高。因此，必须利用信息技术改变传统财务管理模式为集中管理，即通过网络实时传递信息和财务信息化平台共享信息，消除信息孤岛，实现财务数据的集中管理，促进行政事业单位财务管理更加规范化和科学化。

目前，软件部署和财务数据的存储建议模式如下：

实时集中模式（又称完全集中模式）是指主管部门与各下级预算单位之间建立实时的网络通讯系统（专网/公网），只在主管部门设立服务器，整个单位只使用一套财务软件；所有下级预算单位全部通过网络进行日常业务处理，并将所有数据全部实时传递到管理中心的服务器上进行集中存储；服务器由管理中心（总部）进行统一维护与管理，同时还可以通过统一的设置（如人员权限、会计科目等）来实现整个单位财务数据的集中管理。